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科学家绘出普通小麦基因组草图
发表日期: 2014-07-24 作者: Frédéric Choulet等 文章来源:《Science》
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在水稻和玉米基因组被破解多年后,三大粮食作物中最复杂、最困难的小麦基因组绘制工作也有了突破性进展。一个国际科研团队17日宣布,他们绘制完成了普通小麦的基因组草图,距破译小麦全基因组序列这一曾被视为不可能完成的任务仅剩一步之遥。

国际小麦基因组测序协会当天在美国《科学》杂志上发表论文说,他们对一种叫做中国春的小麦品种的每个染色体臂进行了分离、测序及组装,绘制完成了普通小麦的基因组草图。在这张草图中,研究人员可以精确定位”12多万个基因,这些基因中有许多与谷物品质、病虫害抗性或环境耐受性等在农业上具有重要意义的特性相关。

该协会在一份声明中说,这一成果将会带来新一代更加高产和更有可持续性的小麦品种,在变化的环境中满足人口增长的需求

同期《科学》杂志还发表了另一篇论文,公布了小麦最大的染色体——3B染色体的第一条参考序列,这为小麦其余染色体的测序提供了概念验证与模板。

普通小麦种植广泛,是全球约30%人口的主粮。随着全球人口2050年预计达到90亿,有预测称普通小麦须增产70%才能满足未来需求。但普通小麦有21条染色体,每条染色体都大而复杂,其中最大的3B染色体有约8亿个遗传密码字母,是水稻整个基因组的近3倍大,所以破译3B染色体与小麦基因组是一项极其复杂的任务

国际小麦基因组测序协会2005年成立,在50多个国家和地区拥有会员。该机构联合主席卡特琳·弗耶说,普通小麦基因组草图和3B染色体第一条参考序列的公布,是一个了不起的里程碑我们现在已知如何获得其余20条染色体的参考序列,希望能获得足够的资源在未来3年内实现这一目标

此前,三大粮食作物中的水稻和玉米的基因组测序工作已分别于2002年和2009年完成。(引自:生物谷360)

 

Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B

 

Abstract  We produced a reference sequence of the 1-gigabase chromosome 3B of hexaploid bread wheat. By sequencing 8452 bacterial artificial chromosomes in pools, we assembled a sequence of 774 megabases carrying 5326 protein-coding genes, 1938 pseudogenes, and 85% of transposable elements. The distribution of structural and functional features along the chromosome revealed partitioning correlated with meiotic recombination. Comparative analyses indicated high wheat-specific inter- and intrachromosomal gene duplication activities that are potential sources of variability for adaption. In addition to providing a better understanding of the organization, function, and evolution of a large and polyploid genome, the availability of a high-quality sequence anchored to genetic maps will accelerate the identification of genes underlying important agronomic traits.

 

原文链接:http://www.sciencemag.org/content/345/6194/1249721.full.pdf

 


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