生物所科研人员在生态现状评价的基础上，根据生态系统健康理论与方法，承载力理论与方法，服务功能理论与方法，生态位理论与方法，利用数学模型、“3S”技术、拓扑学理论，先后完成了《四川省汶川地震灾区生态环境恢复重建规划》、《乐山市生态环境建设规划》、《攀枝花市生态建设规划》、《宜宾市生态市建设规划》、《南充市生态市建设规划》、《蒲江县生态县建设规划》、《长宁县生态县建设规划》、《游仙区生态区建设规划》、《江安县生态县建设规划》、《宜宾县生态县建设规划》、《高县生态县建设规划》、《珙县生态县建设规划》、《兴文县生态县建设规划》等10余项省、地（市）、县（市、区）级生态建设规划，丰富和发展了生态规划理论、技术、方法体系，规划成果受到社会各界广泛好评。 并为成都市高新区、锦江区、青羊区、都江堰市、彭州市、金堂县、双流县、郫县等10区4市6县环境保护局领导和专家讲授生态规划理论、方法、技术体系；为四川省蒲江县、长宁县、宜宾县等6县党委、政府、人大、政协县级领导讲授生态建设与可持续发展。

　　生物所在我国西南水电开发建设工程对陆生生态与生物多样性的影响评价中，完成了金沙江、雅砻江等多项梯级水电开发的评价，承担了《溪洛渡水电工程陆生生物调查与评价》、《白鹤滩水电工程陆生生物调查与评价》、《杂谷脑河流域梯级开发对生态与环境影响评价》、《城口县白果坪水电站建设项目的环境影响评价报告》、《四川甘孜州雅砻江两河口电站工程影响区陆生生物调查与评价》等，为我国水电能源的开发在环境影响评价方面提供了技术支撑，作出了积极的贡献。